Святейший Патриарх Алексий оценил открытое письмо 10 академиков Президенту РФ как "отголосок атеистической пропаганды прошлого", 4 августа 2007 года
«В открытом письме, которое направили Президенту академики, прозвучало опасение, что в Церкви и в стране набирает силу клерикализм. Но Церковь не вмешивается в жизнь государства, а государство не вмешивается в дела Церкви», — отметил Предстоятель Русской Церкви на состоявшейся сегодня встрече с руководством Удмуртии.
Святейший Патриарх подчеркнул, что после десятилетий атеистической пропаганды государственным властям и Церкви было необходимо установить принципиально новые отношения, партнерство и сотрудничество.
Предстоятель Русской Церкви отметил также, что преподавание Основ православной культуры в школах или теологии в высших учебных заведениях не противоречит принципу отделения Церкви от государства и вполне соответствует сложившейся во всем мире практике.